On s'intéresse souvent à une fonction des quantités mesurées. Le problème est alors de dériver l'incertitude associée à cette estimation.
C'est par exemple le cas en spectroscopie, où on mesure une intensité 
à diverses longueurs d'onde 
(variable indépendante). Les quantités physiquement importantes sont liées aux variations spectrales ; elles s'expriment comme des différences ou des rapports d'intensités à différentes longueurs d'onde, ou comme des fonctions plus complexes de ces intensités. Une incertitude individuelle est associée à chaque mesure spectrale 
. En principe, les incertitudes sur les mesures individuelles sont indépendantes les unes des autres. Si ce n'est pas le cas, il y a un problème avec l'étalonnage de l'instrument et il faut ajouter un terme de covariance dans les formules ci-dessous (on parle improprement de « bruit corrélé », parce qu'un signal inconnu se superpose à celui qu'on mesure).
